31 марта 2023 была одобрена наша заявка на грант РНФ по теме «Перепрограммирование В-клеток памяти с целью создания продуцентов человеческих терапевтических монокональных антител». Руководитель проекта Филатов А.В.
20 марта 2023 В начале месяца вышла наша совместная с австрийскими коллегами статья: Byazrova, M. Gattinger, P. Astakhova, E. Hofer, G. Khaitov, M. Filatov, A. Valenta, R. «Dissection of Antibody Responses of Gam-COVID-Vac-Vaccinated Subjects Suggests Involvement of Epitopes Outside RBD in SARS-CoV-2 Neutralization».
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36982183/
На сайте Medical University of Vienna был опубликован пресс-релиз, посвященный этой статье:
Несмотря на то, что к настоящему времени благодаря вакцинациям, а также после перенесения SARS-CoV-2-инфекции у большинства населения развился специфический иммунитет, случаи заражения COVID-19 продолжают регистрироваться, так как в силу непрерывного мутационного процесса новые варианты вируса «обходят» существующую иммунную защиту. Зачастую сформированного специфического иммунитета оказывается недостаточно, и вопрос оценки «мощности» имеющегося иммунного ответа остается крайне актуальным.
Исследовательская группа из Центра патофизиологии, инфектологии и иммунологии Венского Медицинского Университета (MedUni Vienna) под руководством Рудольфа Валенты пришла к выводу, что для определения способности иммунитета противостоять новому заражению SARS-CoV-2, недостаточно стандартного определения наличия/отсутствия нейтрализующих антител. Более того, количество антител также не является достаточным показателем защиты от новых инфекций.
В недавно опубликованном обзоре на основе результатов, полученных за 3 года пандемии, Рудольф Валента и Пиа Гаттингер подчеркивают, что решающее значение для протекции от повторного заражения имеют нейтрализующие антитела, способные в достаточной степени предотвратить взаимодействие вируса с человеческими клетками. Не-нейтрализующие специфические антитела не гарантируют защиты от заражения вирусом клетки, поэтому их наличие и количество не может являться предиктивным маркером вероятности заражения COVID-19.
Большинство стандартных методик определения SARS-CoV-2-специфических антител не позволяют дифференцировать их свойства. Ввиду инфекционной природы вируса классические серологические подходы для оценки нейтрализующих антител могут проводиться только в узкоспециализированных лабораториях при соблюдении строгих условий безопасности, что сильно ограничивает распространенность таких исследований. В 2020 году группа Рудольфа Валенты разработала простую методику, позволяющую измерить специфические нейтрализующие антитела в условиях стандартной лаборатории. С помощью данного метода можно быстро проанализировать большое количество образцов и оценить степень защиты индивида от новых инфекций. Данная информация представляется особенно ценной в клинической практике, так как позволяет врачу индивидуально определять сроки вакцинации и тип вакцины.
В следующей работе этой научной группы в ходе изучения нейтрализующих антител у вакцинированных людей была идентифицирована «ахиллесова пята» SARS-CoV-2 – ранее неизвестный эпитоп вируса, связывание которого антителами приводит к его нейтрализации. Примечательно, что этот эпитоп является консервативным, то есть он присутствует в разных вариантах SARS-CoV-2. Данные результаты могут быть успешно использованы разработчиками вакцин для создания компонентов, связывающих специфический сайт на поверхности вируса.
Оригинал пресс-релиза можно почитать тут
В журнале CLINICAL & TRANSLATIONAL IMMUNOLOGY нами была опубликована статья «Pattern of circulating SARS-CoV-2-specifi c antibody-secreting and memory B-cell generation in patients with acute COVID-19». https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cti2.1245
За период 2021-2022 статья была признана, как самая цитируемая в этом журнале.
25 февраля 2022. Александр Васильевич Филатов дал интервью в проекте «Завлабы» для сайта pcr.news. Полный текст интервью можно прочитать тут
14 февраля 2022. Нам продлили грант по конкурсу РНФ «Анализ долговременной В-клеточной иммунологической памяти после перенесенной инфекции SARS-CoV-2».
2 апреля 2019. Мы получили грант по конкурсу РНФ «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами». Тема нашего проекта: Cоздание антиген-специфических иммортализованных клонов В-лимфоцитов человека, предназначенных для получения терапевтических моноклональных антител. Эта новая для нас тема теперь получит финансовую поддержку.
Март 2019. Альфира Романова прошла по льду Байкала 200 км вокруг острова Ольхон.
28 февраля 2019. Вышла из печати наша статья
A. Zotova, A. Pichugin, A. Atemasova, E. Knyazhanskaya, E. Lopatukhina, N. Mitkin, E. Holmuhamedov, M. Gottikh, D. Kuprash, A. Filatov, D. Mazurov Isolation of gene-edited cells via knock-in of short glycophosphatidylinositol-anchored epitope tags. Sci. Rep., 2019, v9, 3132. https://www.nature.com/articles/s41598-019-40219-z IF = 4.609.
Эта работа явилась совместным трудом нескольких лабораторий. Метод нокаутирования генов с помощью системы CRISPR/Cas9 был модифицирован так, что поиск нокаутных клеток облегчен с использованием дополнительных тагов. Метод предложено назвать SORTS (Surface Oligopeptide knock-in for Rapid Target Selection).
Февраль 2019. Таня Цой после защиты диссертации перешла на работу в МИФИ в лабораторию Набиева И.Ф. Теперь она будет работать по мегагранту, направленному на создание новых диагностических систем на основе квантовых точек. Желаем Тане успехов на ее новом поприще и надеемся, что она не будет забывать свою родную лабораторию.
26 ноября 2018 Татьяна Цой защитила кандидатскую диссертацию «Структурно-функциональные особенности лимфоцитарного фосфатазо-ассоциированного фосфопротеина LPAP». Защита прошла на заседании диссертационного совета МГУ по специальности иммунология.
ноябрь 2018 В журнале Биохимия опубликована наша статья «Фосфатазо-ассоциированный фосфопротеин является субстратом протеинкиназы CK2. (Биохимия, 2018, т. 83, № 11, с. 1700-1709.) Текст статьи открыт для просмотра http://link.springer.com/article/10.1134/S0006297918110081
октябрь 2018 Наталья Круглова и Мария Бязрова получили travel grant на участие в Международной школе по иммунологии в Ереване, Армения (19-22 октября 2018) 10th EFIS-EJI South East European Immunology School (SEEIS2018).
Наталья Круглова выступила на школе с сообщением «LPAP — an elusive protein at the heart of lymphocyte signaling», а Мария Бязрова с сообщением «In vitro B lymphocyte stimulation: a step to monoclonal antibody generation».
“Results support the model: following phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) or TCR/CD3 activation of T cells, LPAP is rapidly dephosphorylated at Ser-99 and Ser-172 and slowly phosphorylated at Ser-163. Ser-153 exhibited a high basal level of phosphorylation in both resting and activated cells”.
18 – 22 сентября 2017 Филатов А.В. принял участие в VIII Российском симпозиуме «Белки и пептиды» (Москва). На секции Протеомики он выступил с докладом «Таргетная протеомика лимфоцитарного фосфатаза-ассоциированного фосфопротеина (LPAP)».
10-14 сентября 2017 Наталья Круглова и Анастасия Зотова приняли участие в FEBS Congress в Иерусалиме, где выступили с докладами «The phosphorilation status of Lymphocyte Phosphotase- Associated Phosphoprotein (LPAP) changes dynamically upon lymphocyte activation» и «GeCKO library screening for identification of cellular factors critical for HTLV-1 replication», соответственно.
7-10 сентября 2017 Анастасия Зотова приняла участие в форуме молодых ученых YSF FEBS в Иерусалиме с постерным докладом «GeCKO library screening for identification of cellular factors critical for HTLV-1 replication»
21 августа 2017 Вышла из печати наша статья
Kruglova NA, Meshkova TD, Kopylov AT, Mazurov DV, Filatov AV.
Constitutive and activation-dependent phosphorylation of lymphocyte phosphatase-associated phosphoprotein (LPAP).
PLoS One. 2017 Aug 21;12(8):e0182468. doi: 10.1371/journal.pone.0182468.
Для нас нас это была очень важная публикация.
23 июня 2017 Аспирант лаборатории Татьяна Мешкова вышла замуж, от всей души поздравляем Таню (Цой)!
6 — 8 июня 2017 Филатов А.В. принял участие в форуме «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге» и выступил с устным докладом «Участие лимфоцитарного фосфатаза-ассоциированного фосфопротеина LPAP в активации лимфоцитов».
3/06/2017 Маша Бязрова на отлично защитила дипломную работу бакалавра «Анализ клонального разнообразия генов иммуноглогулинов секвенированных из единичных В-лимфоцитов». Поздравляем!
30/04/2017 Анастасия Зотова выиграла Travel grant на конференцию 17th FEBS Young Scientists’ Forum (YSF), а также последующий 42th FEBS Congress, который будет проходить в Иерусалиме в сентябре 2017 года.
17/03/2017 Российский фонд фундаментальных исследований (РФФИ) одобрил грант 17-04-00526 А «Роль лимфоцитарного фосфатазо-ассоциированного белка (LPAP) во внутриклеточной передаче сигнала при активации В-лимфоцитов»
21/02/17 Зотова А. выступила с устным докладом «Применение полногеномной CRISPR/Cas9 нокаутной библиотеки в иммунологических исследованиях» на IX Международном конгрессе «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, Гостиный двор.
01/01/17 А.В. Филатов и Альфира Романова покорили вершину горы Килиманджаро (а это, между прочим, почти 6000)! С юбилеем Вас, Александр Васильевич!
22/12/16 Коллектив лаборатории праздновал Новый год
1/11/16-4/11/16 Мазуров Д.В. принял участие в III Всероссийской научно-практической конференции «Социально-значимые и особо опасные инфекционные заболевания» в Сочи с устным докладом «Создание безопасных векторов для определения межклеточной трансмиссии вируса ВИЧ-1».
4/10/16-9/10/16 Филатов А.В. принял участие в 5-й съезде биохимиков России, который проводился в Дагомысе с 4 по 9 октября 2016 г., где выступил с докладом «Лимфоцитарный фосфатазоассоциированный фосфопротеин (LPAP) – трансмембранный белок с неизвестной функцией» на секции «Медицинская иммунология».
27/09/16 Наталья Круглова представила постерный доклад на конференции «International Conference “BIOMEMBRANES 2016: Mechanisms of Aging and Age-Related Diseases”, Moscow Institute of Physics and Technology (MIPT), Russia, Dolgoprudny. Название тезисов: «Proteoforms of lymphocyte phosphatase-associated phosphoprotein».
20/09/16 Статья «Determining antigen specificity of a monoclonal antibody using genome-scale CRISPR-Cas9 knockout library» принята в печать редакцией журнала Journal of Immunological Methods.
01/08/16 Лаборатория получила финансирование на выполнение гранта «Экспериментальная оценка возможности секвенирования генов иммуноглобулинов из одиночных В-лимфоцитов»
26/06/16-01/07/16 Филатов А.В. принял участие в форуме «Биомедицина-2016», который проводился в Новосибирске Академгородок, где выступил с докладом «Негибридомные методы получения получения моноклональных антител» на секции «Иммунотерапия и молекулярная визуализация». Со сборником тезисов можно ознакомиться, перейдя по ссылке.
22/04/16 Аспиранты лаборатории Татьяна Мешкова, Наталья Круглова и Анастасия Шунаева выступили с устными докладами на XV научной конференции молодых ученых «Иммунология сегодня: традиции и инновации» в «ГНЦ Институт иммунологии». Н.Круглова заняла в конкурсе докладов третье место, А.Шунаева — второе.
13/04/16-15/04/16 Д.В.Мазуров и А.Шунаева приняли участие в конференции «NIH – RFBR Collaborative Research Partnership: Meeting to Identify Scientific Priorities for U.S.-Russia Research Collaboration in the Prevention and Treatment of HIV/AIDS Co-Morbidities and Workshop for Early-Career Investigators» в Санкт-Петербурге. Выступление А.Шунаевой «Replication of HIV-1 with accessory gene deletions in cell-coculture and cell-free modes of transmission» был отмечен первой премией в номинации «Лучший устный доклад среди молодых ученых».
01/03/16 А.В. Филатов выступил на семинаре по иммунологии в ГУ НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Н.Ф. Гамалеи с докладом «Негибридомные методы получения моноклональных антител».
17/02/16 В лаборатории состоялся семинар по теме «Биоинформатические методы и секвенирование нового поколения» (Н. Круглова и А. Шунаева).
11/02/16-19/02/16 Под руководством А.В. Филатова в лаборатории прошли занятия большого практикума по теме «Гибридомная технология».
28/01/16 Д.В. Мазуров выступил на семинаре по иммунологии в ГУ НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Н.Ф. Гамалеи с докладом «Редактирование генома с помощью CRISPR/Cas в иммунологии и вирусологии: от нокаута гена до регуляции экспрессии».
04/07/15-09/07/15 Татьяна Мешкова принимала участие в конференции FEBS с постером «Identification of multiple phosphoforms of the Lymphocyte Phosphotase Associated Phosphoprotein (LPAP) by site-directed mutagenesis and mass-spectrometry»
Лаборатория иммунохимии 